בבית הספר פועל מרכז טיפולי הנותן מענה רגשי לתלמידים ומשלים את החיזוקים והתגבורים הלימודיים הניתנים להם למיצוי יכולותיהם הלימודיות.
במסגרת הטיפול הרגשי אותו מקבלים התלמידים, הם משחררים מחסומים וחוויות שליליות שחוו בעברם, באמצעים בלתי מילוליים (מוסיקה, ריקוד, אומנות וכו'). הטיפול מאפשר להם לצמוח מבחינה רגשית ולהתגבר על אותן חוויות מודחקות, מה שפותח בפניהם את האפשרות להתפנות ללמידה, לגלות את הכוחות שבתוכם ולחוות הצלחות.
את המרכז מפעילים מטפלים מוסמכים המתמחים במתבגרים ובשיתוף מכללת דוד ילין.
